Per tal de desenvolupar els treballs de transposició i de coordinar les accions de les diferents administracions implicades, al març de 2007 la Comissió Delegada del Govern per a Assumptes Econòmics (CDGAE) va crear un Grup de Treball Interministerial per a la Transposició de la Directiva de Serveis compost pel Ministeri d'Economia i Hisenda (responsable) i tots els altres ministeris (competents) amb el mandat següent:
- Impulsar el procés de transposició de la Directiva.
- Propiciar la coordinació entre els ministeris que siguin competents.
- Elaborar un programa de treball detallat.
Aquest programa de treball, aprovat el juliol per la CDGAE, contempla un esquema general de coordinació entre totes les administracions que consisteix bàsicament en un enfocament sectorial reforçat per una coordinació horitzontal a través d'interlocutors únics.
Per a la coordinació sectorial, cada ministeri utilitza els seus instruments ja existents (conferències sectorials, meses de directors generals...), sense perjudici d'establir esquemes ad hoc a efectes de la DS sempre que calgui.
La coordinació horitzontal s'estructura a partir de la designació d'interlocutors únics per part de ministeris i comunitats autònomes i persegueix un doble objectiu:
- Designar un únic responsable per ministeri i per comunitat autònoma que es responsabilitzi d'impulsar les tasques de transposició en el si de la seva institució.
- Abordar amb aquests interlocutors aquelles qüestions que comprenen diverses matèries i per a les quals l'esquema sectorial no és adequat, com tot el que tingui a veure amb la finestreta única o amb cooperació administrativa.
Finalment, a nivell local, cal destacar la importància de la participació de la Federació Espanyola de Municipis i Províncies (FEMP) als fòrums de coordinació sectorial.